確保研究參與者的安全及福祉

研究者在倫理上必須以研究參與者之健康為首要，若產生利益衝突情形，將損害研究參與者的安全與福祉。

例如：在招募研究參與者的過程中，若贊助商提供激勵獎金以鼓勵研究者加速招募到更多研究參與者，則在次要利益（獎金）的影響下，研究者很可能會不當地忽略研究的主要利益（研究參與者的安全與福祉），而對研究參與者隱瞞研究的風險，使其在未充分知情的情況下簽署同意書；或以醫學研究為例，研究者可能因此鼓勵病患停止原有療程，以爭取其加入新的臨床試驗。凡此種種，可謂皆因利益衝突而違背尊重自主、行善、知情同意等倫理原則，使得研究參與者的權益受損。

另一方面，當研究者具有雙重角色時，此種關係也可能造成利益衝突處境。以醫學研究為例，當研究參與者同時也是研究醫師的病患，他們需要由其醫師（同時是研究者）來治療他們的疾病，這在臨床上是十分常見的，但由於兩造之間的醫療知識及權力的不對等，使得病患／研究參與者更容易去相信其醫師／研究者的決定。一旦醫學研究者處於利益衝突下，可能將次要利益置於主要利益（促進病人健康）之上。在此情況下，若未能有完善的規範與政策來管理利益衝突，則有可能對研究參與者／病患的安全及福祉造成損害。